AMD и биотехнологическая компания Absci интегрировали оптимизированные ядра Triton в модель AbsciBind, работающую на ускорителях AMD Instinct и программном стеке ROCm. По данным компаний, это дало трёхкратное ускорение относительно производственной версии AbsciBind при сохранении качества результатов по протоколам проверки Absci.
AbsciBind оценивает связывание антител с антигенами с помощью совместного предсказания их трёхмерной структуры. Значительная часть времени вывода приходится на две низкоуровневые операции — треугольное внимание и треугольное мультипликативное обновление. AMD ранее оптимизировала эти операции для OpenFold3, а совместная команда перенесла ядра в рабочий конвейер Absci. Те же оптимизации применимы к другим моделям компании с такими операциями, включая AbsciDiff; AMD сообщает, что ядра опубликованы с открытым исходным кодом.
Перед интеграцией Absci развернула среду Instinct, близкую к своему производственному стеку в Oracle Cloud Infrastructure. Инженеры сравнивали вычислительную производительность и качество с существующим парком GPU по внутренним методикам Absci. AMD отдельно предупреждает, что показатели предоставлены Absci, не проверялись AMD независимо и относятся к конкретной конфигурации и нагрузке. Поэтому результат нельзя переносить на все задачи проектирования антител или другие GPU.
После испытаний Absci приобрела в OCI кластер ускорителей Instinct MI300X для разработки Origin-3 — следующего поколения платформы структурной биологии и проектирования антител. Переход на следующее поколение Instinct пока только запланирован и не описывается как завершённый.
