Google DeepMind представила Biomolecular Structure Viewer — встроенный в среду Antigravity инструмент для совместного анализа трёхмерных структур белков. Исследователь и программный агент работают с одним визуальным состоянием: агент может загружать структуры из AlphaFold Database или собственные предсказания учёного, выделять функциональные участки и объяснять гипотезы прямо на модели.
Синхронизация работает в обе стороны. Если исследователь отмечает аминокислотный остаток или закрепляет заметку в области связывания, агент получает этот контекст и может отвечать на вопрос именно о выбранном фрагменте. По замыслу команды, такой общий 3D-холст уменьшает необходимость вручную переносить файлы между базами, скриптами и отдельными программами молекулярной визуализации.
DeepMind показала функцию на задаче поиска антимикробных пептидов. В описанном процессе Antigravity использует специализированную модель ProtNLM для предсказания функций белков по последовательностям аминокислот и помогает просматривать ранее не охарактеризованные белки из UniProt. Исследователь задаёт биологическую цель и выбирает нужные доказательства, а агент координирует запросы к базам, структурный анализ и поиск литературы. Предсказанную структуру кандидата сопоставляют с экспериментально определёнными структурами, чтобы искать удалённое сходство и проверять гипотезу о функции. После вычислительного отбора система сформировала экспериментальный план с проверками активности, взаимодействия с мишенью и токсичности in vitro.
Полученный пептид остаётся лишь вычислительным кандидатом с предполагаемой активностью против возбудителей инфекций дыхательных путей. Он и другие кандидаты проходят лабораторную проверку; результатов, подтверждающих эффективность или безопасность, источник пока не приводит. Поэтому публикация не сообщает о новом лекарстве. Новым продуктовым элементом является именно Biomolecular Structure Viewer, а не отдельный запуск платформы Antigravity.
